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        <title>ASO on 肿瘤前沿精读</title>
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        <description>Recent content in ASO on 肿瘤前沿精读</description>
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            <title>MYC 不可成药魔咒松动了：Cell 扫遍整个基因座，锁住一个能下药的超保守 RNA 元件</title>
            <link>https://www.tianlalu.uk/post/crispr-myc-druggable-rna-element/</link>
            <pubDate>Mon, 09 Nov 2026 00:00:00 +0000</pubDate>
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            <description>&lt;p&gt;MYC 大概是肿瘤学里最著名的&amp;quot;不可成药&amp;quot;靶点。这个转录因子驱动着约七成人类肿瘤的生长，淋巴瘤、乳腺癌、肺癌、肠癌里都能看到它被扩增或过表达。可几十年过去，没有一个小分子真正打到过它。原因不复杂：MYC 靠和 MAX 蛋白牵手在细胞核里干活，表面几乎没有小分子能钻进去的深口袋；更麻烦的是，正常增殖的组织同样需要它，下重手很容易误伤。于是&amp;quot;不可成药&amp;quot;四个字，跟着 MYC 走了快四十年。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;p&gt;《细胞》(Cell) 新刊出的一篇论文换了个思路：打不动蛋白，就打到它的 RNA 上。哥伦比亚大学的团队用近无 PAM 限制的 SpRY-Cas9，把整条 10 kb 的 MYC 基因座一碱基一碱基地敲过去，画出了这条基因的&amp;quot;生存必需地图&amp;quot;。结果出人意料：三分之二的必需位点根本不在编码区，而在那些长期被当作冗余序列的非编码区里。他们从中锁定了一个超保守的 RNA 元件，用反义寡核苷酸（ASO）把它堵住，就能选择性杀死依赖 MYC 的癌细胞。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;为什么-myc-这么难打&#34;&gt;为什么 MYC 这么难打&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;p&gt;MYC 是个转录因子，干的是&amp;quot;开关&amp;quot;的活。它没有酶的活性口袋，靠一段本征无序的区域和 MAX 二聚化，再去抓 DNA 上的 E-box 序列，启动下游几百个基因。小分子抑制剂最擅长打的是有明确结合腔的酶，而 MYC 恰恰没有这个东西。过去二十年的尝试大多绕道走：Omomyc 是一段能抢占 MAX 结合位点的迷你蛋白，已在早期临床里测试；BET 溴结构域抑制剂（JQ1 一类）则是通过掐断超级增强子来间接压低 MYC 转录，但脱靶毒性一直压不住。这些路子的共同尴尬在于，它们要么够不到 MYC 本身，要么连正常细胞的 MYC 一起打。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;一碱基一碱基地问基因座&#34;&gt;一碱基一碱基地&amp;quot;问&amp;quot;基因座&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;p&gt;这篇论文做了一件此前没人做全的事：用 SpRY-Cas9 把整个 MYC 位点的每一个碱基都当作潜在靶点敲一遍。SpRY 是工程改造过的 Cas9，几乎不受 PAM 序列限制，因此能铺出足够密的突变网格，把 10 kb 的基因座在碱基分辨率下扫平。作者再结合大规模并行测序，读出每个位点突变后细胞的存活变化，得到一张&amp;quot;适应性图谱&amp;quot;——哪个碱基动不得，一目了然。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;p&gt;图谱给出的第一条结论就很反直觉。传统上大家默认基因的功能信息浓缩在编码区，但这里 67% 的功能必需碱基对落在非编码序列里。这些必需的非编码位点在人类群体里受到很强的负选择——也就是说，人群里几乎没人带着这些位置的变异，因为它们会致病。有意思的是，它们在跨物种的序列保守性上却相当有限，说明这是一批人类特异的功能元件。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;一个能下药的-rna-元件&#34;&gt;一个能下药的 RNA 元件&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;p&gt;在这张图谱里，团队盯上了 3&amp;rsquo; 非翻译区（UTR）里一个超保守的 RNA 元件。它不编码蛋白，却通过结合 hnRNP L，把 MYC 的 mRNA 拖到细胞核周围翻译，再让新生的 MYC 蛋白顺利入核。翻译和入核这两步，卡住了 MYC 功能的命门。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;pre tabindex=&#34;0&#34;&gt;&lt;code&gt;依赖 MYC 的癌细胞（正常状态）&#xA;MYC mRNA ──► 3&amp;#39; UTR 超保守元件 ──► 结合 hnRNP L&#xA;                                      │&#xA;                                      ▼&#xA;                          mRNA 定位于核周翻译&#xA;                                      │&#xA;                                      ▼&#xA;                          MYC 蛋白入核 ──► 驱动增殖与存活&#xA;&#xA;ASO 处理后&#xA;MYC mRNA ──► 超保守元件被 ASO 阻断 ──► hnRNP L 无法结合&#xA;                                      │&#xA;                                      ▼&#xA;                              mRNA 错位 → 蛋白入核受阻&#xA;                                      │&#xA;                                      ▼&#xA;                              依赖 MYC 的癌细胞死亡&#xA;&lt;/code&gt;&lt;/pre&gt;&lt;p&gt;更关键的是，这个元件可以用药。作者设计了空间阻断型反义寡核苷酸，专门盖住这段序列。在多种依赖 MYC 的癌细胞系里，这些 ASO 选择性清除了肿瘤细胞，而对不依赖 MYC 的细胞影响很小；在患者来源的肿瘤类器官里，ASO 也压住了生长。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;table&gt;&#xA;  &lt;thead&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;th&gt;关键发现&lt;/th&gt;&#xA;          &lt;th&gt;数据 / 细节&lt;/th&gt;&#xA;          &lt;th&gt;意义&lt;/th&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;  &lt;/thead&gt;&#xA;  &lt;tbody&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;必需位点分布&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;67% 位于非编码区&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;非编码序列承载主要功能信息&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;人群选择压力&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;必需非编码位点强负选择&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;变异即致病，功能确实重要&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;跨物种保守性&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;有限&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;人类特异的功能元件&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;核心元件&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;3&amp;rsquo; UTR 超保守 RNA 元件&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;可作为药物靶点&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;作用机制&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;结合 hnRNP L，调控 mRNA 核周定位与蛋白入核&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;定位决定功能&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;      &lt;tr&gt;&#xA;          &lt;td&gt;干预手段&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;空间阻断型 ASO&lt;/td&gt;&#xA;          &lt;td&gt;选择性清除依赖 MYC 的细胞&lt;/td&gt;&#xA;      &lt;/tr&gt;&#xA;  &lt;/tbody&gt;&#xA;&lt;/table&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;这扇门通向哪里&#34;&gt;这扇门通向哪里&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;p&gt;这份工作的分量，在于它给&amp;quot;不可成药&amp;quot;提供了一个新的落脚点。ASO 已经是成熟的成药方式，nusinersen（治疗脊髓性肌萎缩）和 tofersen（治疗 ALS）都是靶向 RNA 的获批药物，只不过过去它们主要用在神经系统和肝脏疾病上。MYC 这条 RNA 通路如果走得通，等于把肿瘤学里最难啃的一块骨头，转译成了一个可以用现有技术栈去攻的问题。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;p&gt;&amp;ldquo;选择性&amp;quot;三个字同样值得注意。MYC 之所以难打，一半卡在&amp;quot;没口袋&amp;rdquo;，一半卡在&amp;quot;正常细胞也要用&amp;quot;。ASO 的效果偏偏集中在对 MYC 依赖度高的癌细胞上，这暗示存在一个治疗窗口。至于这个窗口有多大，动物模型和后续实验会给出答案。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;局限与下一步&#34;&gt;局限与下一步&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;p&gt;现在高兴还早。这是细胞系和类器官层面的数据，没有体内药效；ASO 进入实体瘤的递送效率，本身就是这个领域绕不过去的坎。而且研究只覆盖了 MYC 一个位点，这套方法能不能推广到其他&amp;quot;不可成药&amp;quot;靶点，还要看。下一步的看点很直接：体内模型里的抗肿瘤效果、毒性窗口，以及 ASO 在实体瘤中的递送方案。如果这些都能兑现，MYC 这个老靶点才算真正迎来了翻身的机会。&lt;/p&gt;&#xA;&lt;hr&gt;&#xA;&lt;h2 id=&#34;论文信息&#34;&gt;论文信息&#xA;&lt;/h2&gt;&lt;ul&gt;&#xA;&lt;li&gt;&lt;strong&gt;标题&lt;/strong&gt;：CRISPR mutagenesis of the MYC locus reveals a druggable ultraconserved RNA element&lt;/li&gt;&#xA;&lt;li&gt;&lt;strong&gt;期刊&lt;/strong&gt;：Cell（2026）&lt;/li&gt;&#xA;&lt;li&gt;&lt;strong&gt;作者&lt;/strong&gt;：Shi、Yang、Fnu、Huang、Xing、Alam 等，来自哥伦比亚大学&lt;/li&gt;&#xA;&lt;li&gt;&lt;strong&gt;PMID&lt;/strong&gt;：&lt;a class=&#34;link&#34; href=&#34;https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42982038/&#34;  target=&#34;_blank&#34; rel=&#34;noopener&#34;&#xA;    &gt;42982038&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&#xA;&lt;li&gt;&lt;strong&gt;DOI&lt;/strong&gt;：&lt;a class=&#34;link&#34; href=&#34;https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.10.002&#34;  target=&#34;_blank&#34; rel=&#34;noopener&#34;&#xA;    &gt;10.1016/j.cell.2026.10.002&lt;/a&gt;&lt;/li&gt;&#xA;&lt;/ul&gt;</description>
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